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内地首个结核菌全基因组数据库及分析平台上线

2018-08-09
来源:香港商报网

   【香港商报网讯】记者林丽青 见习记者王静抒 报道:8日上午,全国首个结核菌全基因组数据库及分析平台在深圳上线。该平台是国内首个结核菌全基因组数据库及分析平台,集数据存储、自动流程分析、耐药预测、遗传距离计算等功能于一体并开放注册使用。这将显著提高内地结核公共卫生事件的应对水平和处置能力,避免出现下一个“桃江事件”。2017年年底,湖南桃江学校结核病公共卫生事件引起了业内外人士的高度重视。

  8日-10日,由中国防痨协会结核病基础专业分会主办、深圳市慢性病防治中心和复旦大学高谦教授课题组联合承办的“结核病公共卫生事件病原同源性鉴定实用技术-基因型分析理论与实验操作培训班”在深圳市慢性病防治中心举行。当天上午,“结核菌全基因组数据库分析平台SAM-TB”正式上线。

  结核菌基因水平的同源性分析,有助于判定结核菌传播路径。如果两位患者体内的结核菌基因序列完全一样或者基本一样,那么这两位患者相互传染的可能性就极大,否则两者的疾病与相互之间的传播并无关系。深圳市慢病防治中心通过“三名工程”引进的复旦大学结核病防控策略和示范应用研究团队带头人高谦教授表示,“同一稳定群体,比如学校,在半年内发现10例以上的结核病患者,通过基因分型应急监测,若结核菌基因型相同,则定义为结核病爆发,需要采取局部应急防控措施。”

  此外,随着耐药结核病的广泛流行,结核菌的药物敏感性实验对结核患者的用药选择成为必要条件。然而结核菌的慢生长特性,常规耐药检测通常需要一个月以上才有结果,更重要的是很多药物还没有良好的耐药检测方法。而刚上线的结核菌全基因组数据库分析平台,利用全基因组高通量测序数据,通过该平台的自动化软件,可以快速全面获得结核菌的耐药信息,有利于临床医生及时选择有效药物对患者进行治疗。

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